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新疆生地所搭建全球首個耐脫水植物基因組數(shù)據(jù)庫

2024-01-08來源:新疆日報

石榴云/新疆日報記者謝慧變從中國科學院新疆生態(tài)與地理研究所獲悉:新疆生地所在干旱區(qū)生物種質(zhì)資源收集和保育平臺建設方面取得重要進展,已搭建全球首個耐脫水植物基因組數(shù)據(jù)庫,為我國干旱區(qū)生物多樣性保育和可持續(xù)利用提供了重要科技支撐。這是新疆生地所5日發(fā)布的2023年重要科技進展之一。

耐脫水植物基因組數(shù)據(jù)庫包含26套營養(yǎng)體耐脫水相關(guān)植物基因組數(shù)據(jù)資源,其中10套為苔蘚植物的基因組。

記者了解到,耐脫水被認為是陸地植物中一種古老且極為罕見的性狀,主要存在于種子和孢子等繁殖體中。耐脫水植物具有“干而不死,遇水復蘇”的典型特征,被認為是植物界中的“三體人”。

耐干苔蘚就是耐脫水植物的一種。耐干苔蘚廣泛分布在古爾班通古特沙漠,覆蓋在沙子表面,被譽為“沙漠地毯”,遇水后能在3秒內(nèi)迅速變綠,對維持沙漠穩(wěn)定性有很好的作用。

新疆生地所研究員張道遠團隊研究發(fā)現(xiàn),沙漠極端的環(huán)境造就了耐干苔蘚超強的耐干燥、耐高溫等綜合抗逆性,也成為挖掘抗逆基因的好材料。

新疆生地所副研究員高貝介紹,過去十年,測序技術(shù)的進步與普及應用使我們有機會深入研究這類耐脫水植物的基因組及其演化特征。然而,尚未有專門的綜合數(shù)據(jù)庫來整合這些寶貴的基因組資源。

新疆生地所研究員張道遠團隊基于對脫水植物基因組學研究多年的積累,搭建的全球首個耐脫水植物基因組數(shù)據(jù)庫,整合了豐富的生物信息學分析工具模塊,如多種類型的序列比對、同源基因簇搜索等,為相關(guān)研究人員對該類植物的基因數(shù)據(jù)資源整合、發(fā)掘和利用提供了參考。

干旱區(qū)具有豐富的抗干旱、高溫、鹽堿等逆境的生物種質(zhì)資源,建設干旱區(qū)生物種質(zhì)資源庫,對種質(zhì)資源的收集保育、研究及開發(fā)利用至關(guān)重要。